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# Réunion PhyloAlps #14
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*18/09/2018*
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## Participants
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* Frédéric Boyer
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* Bruno Bzeznik
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* Eric Coissac
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* Anthony Hombiat
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### Intégration continue
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***Docker**isation* du projet PhyloAlps :
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* Réfléchir au degré de granularité pour le découpage en container
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* Développer tests unitaires, fonctionnels et de non régression
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* Elaborer un jeu de données test
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* Gérer les différentes versions de la base de données
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### Exploration des échantillons via la taxonomie
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* La taxonomie de référence est celle du NCBI
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* Faire le lien avec les autres référentiels taxonomiques
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* Filtrer/Différencier les taxa selon qu'il existe ou non des échantillons rattachés
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### Annotations
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3 types d'annotations :
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* `MessageAuto` : message généré automatiquement sur un assemblage d'ADN
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* `MessageManual` : message laissé par un expert sur un objet lié à l'échantillonnage ou à la génomique
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* `MessageStatus` : message laissé par un expert justifiant de la validation ou bien du rejet d'un objet lié à l'échantillonnage ou à la génomique
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Les `MessageAuto` et `MessageManual` possède un degré de sévérité à 3 niveaux : `INFO`, `WARNING` ou `ERROR`
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Les `MessageManual` et `MessageStatus` possède un attribut indiquant la version de la base de données
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Les `MessageManual` et `MessageStatus` sont liés à un compte utilisateur PhyloAlps
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### Intégration du règne animal
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Généraliser le nom des concepts liés aux plantes pour englober le règne animal :
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* `Herbarium` -> `Collection`
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* `Herbpress` -> `Specimen` |