Réunion PhyloAlps #4

11/04/2017

Participants

• Eric Coissac
• Frédéric Boyer
• Roland Douzet
• Anthony Hombiat
• Sebastien Lavergne
• Christophe Perrier
• Cristina Roquet

Modèle de données

• Ajouter lien entre Sample et Taxon avec note décrivant la règle métier selon laquelle la relation existe entre un Sample et un Taxon seulement si le Sample n'est pas lié à un HerbPress, auquel cas c'est l'HerbPress qui est lié au Taxon correspondant
• Un ou plusieurs Curator est (sont) lié(s) à un Herbarium, et non pas à un HerbPress
• Une Occurrence est un concept plus générique qu'un Sample, lequel est plus générique qu'un HerbPress
• Règle métier selon laquelle un Observer est un Curator si l'Occurrence à laquelle il est rattaché est un HerbPress
• Ajouter un concept Campaign représentant une campagne de collecte de SampleSet

Environnement de développement

• Voir avec Patrick Juen Ingénieur système LTHE mutualisé interlabo
• Voir avec Bruno Bzeznik où installer des machines virtuelles pour la phase de développement

Site Web PhyloAlps.org

• Ajouter description implication partenaires projet
• Ajouter contenu scientifique du projet
• Contextualiser : point de départ arc Alpin mais ouverture à terme à l'ensemble du monde

Angiosperm Phylogeny Group

Référentiel taxonomique APG : Mobot (Missouri Botanical Garden) Angiosperm Phylogeny Group classification sous forme de documentation HTML

• Implémenter un parser pour récupérer la taxonomie APG

Base de données PhyloAlps

• Pour chaque espèce de la base de données PhyloAlps, extraire les familles
• Filtrer les espèces pour lesquelles il n'existe que des synonymes et demander à Rolland d'identifier le nom accepté parmi les synonymes