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# Réunion PhyloAlps #6
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*12/05/2017*
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## Participants
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* Frédéric Boyer
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* Eric Coissac
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* Anthony Hombiat
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* Sébastien Lavergne
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## Référentiel taxonomique INPN
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* Rangs taxonomiques :
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* `inpn:CLAD` <=> `ncbi:NoRank`
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* `inpn:Dumm` <=> `ncbi:NoRank`
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* `inpn:RG` <=> `ncbi:Reign`
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* `inpn:Biota`<=> `ncbi:Root`
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## Référentiel taxonomique NCBI
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* Les taxons non validés apparaissent dans la base préfixés par "Candidatus" ou "Candidate"
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## TODO
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* Intégrer les liens d'un service de réconciliation de référentiel taxonomique par l'intermédiaire du nom scientifique (`pato:scientificName`) sous forme de graphe
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* Intégrer le 3ème référentiel taxonomique : [MoBoT]
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* Conformer l'ontologie de la taxonomie PhyloAlps aux standards, en particulier, au [Taxonomic Concept (Transfer) Schema]
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* Rédiger le README.md sur https://git.metabarcoding.org/phyloalps/phylotaxo/tree/master
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* Installer OpenLink Virtuoso pour interroger simultanément les différentes base de données taxonomiques grâce aux [requêtes fédérées de SPARQL 1.1]
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[Taxonomic Concept (Transfer) Schema]:http://tdwg.napier.ac.uk/
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[MoBoT]:http://tdwg.napier.ac.uk/
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[requêtes fédérées de SPARQL 1.1]:https://www.w3.org/TR/sparql11-query/#basic-federated-query |