meetings/md/2017.05.12.md

+# Réunion PhyloAlps #6
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+*12/05/2017*
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+## Participants
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+* Frédéric Boyer
+* Eric Coissac
+* Anthony Hombiat
+* Sébastien Lavergne
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+## Référentiel taxonomique INPN
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+* Rangs taxonomiques :
+  * `inpn:CLAD` <=> `ncbi:NoRank`
+  * `inpn:Dumm` <=> `ncbi:NoRank`
+  * `inpn:RG` <=> `ncbi:Reign`
+  * `inpn:Biota`<=> `ncbi:Root`
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+## Référentiel taxonomique NCBI
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+* Les taxons non validés apparaissent dans la base préfixés par "Candidatus" ou "Candidate"
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+## TODO
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+* Intégrer les liens d'un service de réconciliation de référentiel taxonomique par l'intermédiaire du nom scientifique (`pato:scientificName`) sous forme de graphe
+* Intégrer le 3ème référentiel taxonomique : [MoBoT]
+* Conformer l'ontologie de la taxonomie PhyloAlps aux standards, en particulier, au [Taxonomic Concept (Transfer) Schema]
+* Rédiger le README.md sur https://git.metabarcoding.org/phyloalps/phylotaxo/tree/master
+* Installer OpenLink Virtuoso pour interroger simultanément les différentes base de données taxonomiques grâce aux [requêtes fédérées de SPARQL 1.1]
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+[Taxonomic Concept (Transfer) Schema]:http://tdwg.napier.ac.uk/
+[MoBoT]:http://tdwg.napier.ac.uk/
+[requêtes fédérées de SPARQL 1.1]:https://www.w3.org/TR/sparql11-query/#basic-federated-query