Gobiclean : --save-graph produit des séquences avec From "-" et To "-"
Commande lancée :
gobiclean --save-ratio graph_euka03.csv --min-eval-rate 100 GWM-1107.sample.uniq.fasta > GWM_euka03.clean.fasta
Dans graph_euka03.csv, on trouve simultanément des From = "-" et To "-".
Dans mon cas :
grapheuka03 <- read.csv("~/Documents/These/euka03/graph_euka03.csv")
nrow(grapheuka03 %>% filter(From == "-" & To == "-"))
[1] 39
Les fichiers sont trop gros pour que je les inclue.