# Réunion PhyloAlps #9

*28/11/2017*

## Participants

* Martì Boleda
* Frédéric Boyer
* Eric Coissac
* Anthony Hombiat
* Christophe Perrier
* Maxime Rome
* Cristina Roquet Ruíz

## Deploiement prototype

* Demande de service de virtualisation chez GRICAD après échange avec Nicolas Gibelin. Caractéristiques de la machine virtuelle demandées :
  * OS : Autre linux (64 bits)
  * CPU : 8
  * RAM : 16Go
  * Espace disque : 100Go
  * Profile de VM : normal
  * Sauvegarde auto : oui
  * Coût estimé : 550€
* Restreindre l'accès via `.htpasswd`

## Interface graphique

* Ajouter un bouton d'export de la BD au format MS Excel
* Utiliser reverse geocoding (Geonames.org) à l'import puis à titre indicatif dans l'éditeur

## Données

* Données génomiques sur le noeud `luke23`
  * chemin d'accès : `/bettik/LECA/phyloskims/data/prerelease/phyloalps`
  * rawseq ID : projectID + labID (exemples : `PHA00510`, `CAR00490`)
  * log de la commande d'indexation
  * fichiers `.done` ou `.error` selon que l'opération s'est déroulée avec succès ou non
* Utiliser sshfs pour reconstruire l'arborescence sur la VM
* Données phénotypiques : interfacer Androsace
* Données taxonomiques : interfacer TNRS
* Intégrer jeux de données échantillons WSL
* Intégrer jeux de données parasites LECA