# Réunion PhyloAlps #11

*29/01/2018*

## Participants

* Martí Boleda
* Frédéric Boyer
* Eric Coissac
* Rolland Douzet
* Anthony Hombiat
* Sébastien Lavergne
* Christophe Perrier
* Maxime Rome
* Cristina Roquet-Ruíz

## Fichiers séquence

Localisation des fichiers séquence sur Luke : `/bettik/LECA/phyloskims/data` :
* `prereleases/` : version des séquences modifiable, étape préalable à la publication des données
* `releases/` : contients les dossiers correspondant aux différentes versions des données publiées
* `release/goodies/` : fichiers générés à partir des fichiers séquence stables (dossier privé)

Identification des fichiers séquence :
* 3 lettres majuscules correspondant au nom du projet,
* 6 chiffres correspondant au labID

Exemples : `CAR000510`, `PHA000490`

## Parts d'herbier
Numérisation de part d'herbier sur demande : créer une adresse mail de contact dédiée

## Délivrables

Pour chaque délivrable :
* Générer un diff/changelog entre chaque release
* Vérifier la validité des taxID du NCBI
* Mettre à jour en cas de lien cassé :
  * suppression
  * remplacement
  * taxID réservé mais pas encore rendu public

## TODO
* Ouvrir la machine virtuelle vers l'extérieur sur le port 80 (dgdsi-securite@univ-grenoble-alpes.fr)
* Générer certificat SSL pour connexion sécurisée en HTTPS ([letsencrypt.org](https://letsencrypt.org/))
* Câbler l'interface d'édition avec la base de données
* Monter le système de fichiers des séquences depuis Luke sur la machine virtuelle
* Intégrer l'information taxonomique à l'interface
* Intégrer les modifications de Martí dans la base de données