#11
Réunion PhyloAlps29/01/2018
Participants
- Martí Boleda
- Frédéric Boyer
- Eric Coissac
- Rolland Douzet
- Anthony Hombiat
- Sébastien Lavergne
- Christophe Perrier
- Maxime Rome
- Cristina Roquet-Ruíz
Fichiers séquence
Localisation des fichiers séquence sur Luke : /bettik/LECA/phyloskims/data
:
-
prereleases/
: version des séquences modifiable, étape préalable à la publication des données -
releases/
: contients les dossiers correspondant aux différentes versions des données publiées -
release/goodies/
: fichiers générés à partir des fichiers séquence stables (dossier privé)
Identification des fichiers séquence :
- 3 lettres majuscules correspondant au nom du projet,
- 6 chiffres correspondant au labID
Exemples : CAR000510
, PHA000490
Parts d'herbier
Numérisation de part d'herbier sur demande : créer une adresse mail de contact dédiée
Délivrables
Pour chaque délivrable :
- Générer un diff/changelog entre chaque release
- Vérifier la validité des taxID du NCBI
- Mettre à jour en cas de lien cassé :
- suppression
- remplacement
- taxID réservé mais pas encore rendu public
TODO
- Ouvrir la machine virtuelle vers l'extérieur sur le port 80 (dgdsi-securite@univ-grenoble-alpes.fr)
- Générer certificat SSL pour connexion sécurisée en HTTPS (letsencrypt.org)
- Câbler l'interface d'édition avec la base de données
- Monter le système de fichiers des séquences depuis Luke sur la machine virtuelle
- Intégrer l'information taxonomique à l'interface
- Intégrer les modifications de Martí dans la base de données